中文网站
Nat med | Микробиомдун иммундук системасынын иммундук системасынын интеграцияланган шишик картасын картага түшүрүү үчүн көп-микроб
Айткы курон рагына арналган биомаркерлер көп кездешкен болсо да, учурдагы клиникалык көрсөтмөлөрдү дарылоо сунуштарын аныктоо үчүн ДНКнын тууралоочу метастастын-метастизациясы (MMR) аныктамалын аныктоого болот. Окумуштуулар гендүү иммундук жооптордун, микробдук профилдер менен шишик строма ортосунда биригүүчүлөрдүн жетишсиздигин, микробдук профилдер жана шишик строма штрихтагы Атлал (TCGA) Колоректалдык рак оорусу жана бейтаптын жашоосу.
Изилдөө жүргүзүлгөндөй, баштапкы колобалалал-рак оорусунун өсүшү, анын ичинде рак-октун чеберчилиги, иммундук уюлдук, микромалдык мүнөздөгү сандык мүнөздөмөлөрүн өркүндөтүп, клиникалык натыйжаларга ээ болгон, бирок алардын өз ара мамилелери бейтаптын натыйжаларына таасир эткенин түшүнүксүз.
Жакында Сидра медициналык изилдөө институтунун студенттери менен байланышкан фенотиптик комплекстүүлүктүн жана натыйжанын тобу менен бөлүштүрүү үчүн, Микробиом мүнөздөмөлөрүн жана иммундук-укра менен константаларды бириктирип, бир топ аман калуу деңгээли (ICR) менен бир топ аман калуу упайларынын тобун (микроскорс) бөлүп чыгарып, тастыктады. Команданын негизги тоңдурулган үлгүлөрүн ар тараптуу геномдук талдоо, анын ичинде РНКнын, анын ичинде РНКнын жана дени сак болдуу ткань, анын ичиндеги Т-клетканын кабылдагычтары жана 16s бактериялык геномдук гендин, микробиомду мүнөздөө үчүн толугу менен шишик-гежендин секвенциясы менен коштолгон 48. Изилдөө жаратылыш дары-дармектеринде "интеграцияланган шишик, иммундук жана микробиома атласы" катары басылып чыккан.
Тарых медицинасында жарыяланган макалада жарыяланган
AC-ICAM сереп
Окумуштуулар ортогоналдык геномдук платформасын колдонушкан, бейтаптардан жаңы тунук тешиктин үлгүлөрүн талдоо үчүн ортодогу ткань (шишик-нормалдуу жуптарга) түздөн-түз жоонпордук диагнозу менен чектешпегендиктен жасалган чектеш жасалган (шишик-нормалдуу жуптар). Секциянын сапатына жана RNA-SEQ маалыматтарын контролдоого негизделген Сүйлөшүү тобу Sidra-lumc ac-icam: Иммундук-рак-рак-микробиоманын өз ара аракеттенүүсү (1-сүрөт).
ICR колдонуп молекулярдык классификация
Иммундук генетикалык маркерлер үчүн иммундук генетикалык белгилер топтомун (ICR) үзгүлтүксүз четке кагуу (ICR), илимий команданы ар кандай рак типтеги 20 ген панелинин, анын ичинде меланома, табарсык рак оорусуна салып, аны оптималдаштырды. ICR ошондой эле, ар кандай рак оорусуна байланыштуу иммунотерапия жообу менен байланышкан.
Биринчиден, изилдөөчүлөрдүн ICR ICAT когорттук когорттун ICR компаниясынын кол тамгасын тастыктаган ICR ICR компаниясынын кол тамгасын тастыкташты. Изилдөөчүлөр иммундук молекулярдык субтитрлер (CMS) менен байланышкан иммундук молекулярдык субтитрлер (CMS) менен байланышкан, бул консенсус молекулярдык субтитрлер (CMS) менен байланышкан. CMS категорияларына CMS1 / иммундук, CMS2 / Canonical, CMS3 / метаболикалык жана CMS4 / Mesenchymal. Анализ көрсөткөн ICR упайлары CMS публицесинде рак клетка жолдору менен терс түрдө байланышкан жана иммунозуппрессивдүү жана стром-байланыш менен байланышкан жолдор менен оң байланышта болгон оң корреляциялар байкалган.
Бардык CMS, табигый өлтүргүчтүн молчулугу (NK) Момундун молчулугу ICR ичиндеги иммундук публикациялар (1c 1c).
1-сүрөт. AC-ICAM ICAM Design, Иммундук-негизделген гендин колу, иммундук жана молекулярдык субтитрлер жана аман калуу.
ICR чабуулун байытылган, клоналдык жактан амфлификацияланган Т-клеткалар
Т-клеткалардын азчылыгы гана шишик ткандары шишикке каршы антигендер үчүн конкреттүү болгон деп билдирилген (10% аз). Демек, тумор тумордун көпчүлүгү ТКСандер Т-клеткалар деп аталат. Стиль клетка жана лейкоциттерде (РНК-SEQ) стажы (RNA-SEQ деп табылса), ал стерромалдык субпорттук субпопуляцияларында кадимки Тцерлердин саны (РНК-SEQ) байкалган (RNA-SEQ) байкалган (2A сүрөт). ICR кластерлеринде (жалпы жана CMS классификациясы) ICR жогорку жана CMS субтека CMS1 / иммундук топтордо (2c сүрөт) (2c сүрөт) (2c сүрөт) (2C) белгилешти. Транскриптомду (18,270 ген), алты ICR гендеринин (IFNG, stat1, irf1, ccl5, gzma жана cxcl10) TCR иммундук сец клондуктары менен байланышкан алдыңкы он гендин арасында (2D сүрөт) оңго оң таасирин тийгизди. ММмунокеске челектүүлүгү шишик-жоопкерчиликтеги CD8 + маркерлерин колдонуп, корреляциялардан жасалган эң көп иммундук гендер менен байланыштырылган (2F жана 2G). Жыйынтыктап айтканда, жогоруда талдоо ICR колтамгасынын кол тамгасы байыган, клоналдык амплелген таларынын бар экендигин жана анын прогностикалык кесепеттерин түшүндүрүп бере алат деп божомолдойт деп болжолдойт.
2-сүрөт. TCR чеберлери жана иммундук байланышкан гендер, иммундук жана молекулярдык субтиптер менен байланышуу.
Дени сак жана колониялык рак оорусундагы микробиом курамы
Изилдөөчүлөр ДНКны 246 пациенттин дени сак түстөгү ткандарды колдонуп, 16-рРНАнын катышуусун аткарышты (3a сүрөт). Текшерүү үчүн, изилдөөчүлөр үчүн 16 жашка чейинки рРНК ген генди кошумча 42 шишик үлгүлөрүнөн анализ кылбаган кадимки ДНК үлгүсүнө алып келген кошумча 42 шишик үлгүлөрүнөн кошумча анализделди. Биринчиден, изилдөөчүлөрдүн салыштырмалуу өсүмдүктөрүнүн салыштырмалуу салмактарын жана ден-соолукка пайдалуу ичеги-карындын ортосундагы ортосундагы салыштырмалуу көп флораны салыштырды. Шишиктердин клррненттери дени сак үлгүлөргө салыштырмалуу шишиктерде бир кыйла көбөйдү (3a-3D сүрөт). Мен Альфа түрдүүлүгүнүн (ар түрдүүлүк жана түрлөрдүн ар түрдүүлүгүнүн ар түрдүүлүгүнүн ар түрдүүлүгүнүн ар түрдүүлүгү жана молчулук молчулугу ICR-Жогорку шишиктерге салыштырмалуу Микробдук ар түрдүүлүктүн жөнөкөй төмөндөшү байкалган жок.
Клиникалык профилдер менен клиникалык профилдер менен клиникалык натыйжалар менен клиникалык проблемалар менен клиникалык натыйжалар менен таанышуу үчүн, 16 жашка чейинки рРННА генден турган маалыматтарды колдонууга багытталган маалыматтарды колдонууга багытталган маалыматтарды колдонууга багытталган. AC-ICAM246, Изилдөөчүлөр Нөлдүк эмес коэффициенттер менен 41 өзгөчөлүктү тандап, MBR Classifiers деп аталган нөлдүк коэффициенттери бар 41 өзгөчөлүктү тандап алышты (3F сүрөт).
Бул машыктырууда (ICAM246), төмөн MBR упайы (MBR <0, төмөн MBR) өлүмгө дуушар болуу коркунучу менен байланышкан (85%). Окумуштуулар ассоциацияны төмөн MBR (тобокелдикке) жана эки көз карандысыз эки тарапка (ICAM42 жана TCGA-CAД) төмөн мбын (тобокелдик) менен узартууну ырастады. (3-сүрөт) Изилдөө Чемишке жана ден-соолукка пайдалуу колониялык кыртышка окшош болгон Эндогастрдык кокчи жана Мбр упайларынын ортосунда күчтүү корреляция көрсөткөн.
3-сүрөт. Микробиом жана дени сак кыртыштар жана сергек кыртыштарда жана ICR жана чыдамдуу жашоо.
Корутунду
Бул изилдөөдө колдонулган көп-мультификациялык мамиле Молекулярдык жооптордун колобуралык рагындагы рак оорусуна байланыштуу жана микробиомия менен иммундук системанын өз ара аракеттенүүсүн ачып берет жана микробиомия менен иммундук системанын өз ара аракеттенүүсүн ачып берет. Шишик жана дени сак ткандардын тереңдиги ИКИнин прогностикалык таасири астындагы шишикти байып, антигенге контролдук-контрикалык тик клеткаларын басып алуу мүмкүнчүлүгүнө байланыштуу болушу мүмкүн экендиги аныкталган.
Чыр-чатак микробиомдун түзмөсүн AC-ICAM үлгүлөрүндө 16-1 RRNA ген гендигин колдонуп талдоо менен, командасы күчтүү божомолдоо менен микробиома колтамгасын аныктады (MBR тобокелдиги) күчтүү прогникалык мааниси бар. Бул колу шишиктин үлгүлөрүнөн алынган болсо да, ден-соолукка пайдалуу Колоректумдун жана дени сак мышык мбыны микробиомдун микробиомасынын курамын тартуулашы мүмкүн деп болжолдонууда. ICR жана MBR упайларын айкалыштыруу менен, колониялык рак оорулары бар бейтаптарды болжолдой турган көп жаш курч студенттик биоморкерди аныктоого жана тастыктоого мүмкүн болду. Изилдөөнүн көп Omic маалымат базасы CORON рак оорусунун биологиясын жакшыраак түшүнүү үчүн ресурс берет жана жекелештирилген терапевтикалык мамилелерди табууга жардам берет.
Пост убактысы: июнь-15-2023
Купуялык жөндөөлөрү