ДНК метиляциялык тесттен өтүү үчүн чукуларды жана лейкемия скрининин эрте скрининин алгачкы скринингинин алгачкы скринингинин смартфондор менен бириктирилген!

Ликвид биопсиясынын негизинде рак оорусунун алгачкы багыты - акыркы жылдары АКШнын Улуттук Рак Рак институту сунуш кылган жаңы багыт, алгачкы ракты же андан да сонун жырткычтарды аныктоо максатында жаңы багыт. Ал ар кандай зыянкечтер, анын ичинде өпкө рагы, гастроинтесталдык шишиктерин, Gliomas жана гинекологиялык шишиктерди, Глиома жана гинекологиялык шишиктер үчүн биомаркерлер катары кеңири колдонулган.

Метиля пейзажын аныктоо үчүн платформалардын пайда болушу (метилссак)

Жакында окумуштуулар бир метиляциялык пейзажды аныктоо үчүн жөнөкөй жана түздөн-түз сезүү аянтчасын иштеп чыгышты. Лейкемия үчүн эрте скрининг ДНК үлгүсүнөн, болжол менен 90,0% тактык менен аткарылгандан кийин 15 мүнөттүн ичинде аткарылышы мүмкүн. Макаланын аталышы адам кандагы рак-до днасын тез аныктоо - Цасмиймин-капталган аунпс жана машинаны үйрөнүү жана машинаны үйрөнүү

1-сүрөт. Рак / Айнп-Аунспер компоненттери аркылуу Рак / Айнп компоненттери үчүн Рак / Айнеп компоненттери үчүн жөнөкөй жана тез сезимтал платформа эки жөнөкөй кадам менен ишке ашат.

Бул 1-сүрөттө көрсөтүлгөн. Биринчиден, ДНК үзүндүлөрүн таркатуу үчүн суу эритмеси колдонулган. Андан кийин кист / аунптер аралаш эритмеге кошулду. Нормалдуу жана кооптуу ДНК ар кандай метиляциялык касиеттери бар, натыйжада ДНКнын ар кандай үлгүлөрү менен, ар кандай өзүн-өзү чогултуу үлгүлөрү бар. Нормалдуу ДНК жутуп, Кейста / Айнптарды агрегатташтырат, бул Кипт / Айнпстин кызыл жылдырылган мүнөзүнө алып келет, ошондуктан кызыл түстөгү кызгылт көк түстөгү көздүн көзү менен байкалат. Ал эми Рак ДНКнын уникалдуу метляциялык профили ДНКнын фрагменттери чоңураак кластерлерди өндүрүүгө алып келет.

96-сулуу плиталардын сүрөттөрү смартфон камерасын колдонуп кабыл алынды. Рактын ДНКсы спектроскопияга негизделген ыкмаларга салыштырмалуу машинаны үйрөнүү менен жабдылган смартфон менен жабдылган.

Чыныгы кан үлгүлөрүнө рак скрининг

Сезимдүүлүк аянтчасынын пайдалуулугун узартуу үчүн, тергөөчүлөр чыныгы кан үлгүлөрүнө чейин кадимки жана какшыктык ДНКнын ортосунда ийгиликтүү айырмаланган сенсорду колдонушкан. CPG сайттарындагы метиляциялык үлгүлөр генететикалык түрдө жөнгө салуучу гендин сөзүн жөнгө салат. Дээрлик бардык рак оорусунун түрлөрүндө, ДНКнын металлациясынын өзгөрүшү жана ошентип, Тумоуригеннесимди жайылтуу гендердин өзгөрүлүшүнө алмаштырылган гендердин көрүнүшү өзгөрүлдү.

ДНКнын металлациясы менен байланышкан башка пансионаттар катары, изилдөөчүлөр Лейкемикалык пенсшектердин натыйжалуулугун айырмалоочу лейяемиялык пейзаждын натыйжалуулугун териштирүү үчүн схема пациенттеринин кан үлгүлөрүн колдонушкан. Бул метиляциялык пейзаж биоморкери тез эле leukemia скринингдик ыкмаларын гана эмес, ошондой эле бул жөнөкөй жана түз ишмени колдонуп, кеңири таралган дискристтерди эрте аныктоо мүмкүнчүлүгүн көрсөттү.

31 лейкемия бейтаптан жана 12 ден-соолугу чың адамдан кан үлгүлөрүнөн ДНК талдоого алынган. 2А сүрөтүндөгү кутучада көрсөтүлгөндөй, рактын үлгүлөрүнүн салыштырмалуу соругу (δa650 / 525) ДНКнын кадимки үлгүлөрүнөн төмөн болгон. Бул, негизинен, Кыш / аунпстин агрегагесине жол бербестен, Рак ДНКнын тыгыз агрегатасына алып келген күчөтүлгөн гидрофобиканын натыйжасында болгон. Натыйжада, бул наногликлар рак агрегаттарынын сырткы катмарларында толугу менен чачырап кетишкен, бул Киш / Аюнспордун ар кандай дисперсиясы бар, кадимки жана рак дна агрегаттарында ар кандай дисперсия болгон. Андан кийин ROC Ийрищлщгщной босогосун δA650 / 525 наркынын максималдуу мааниге чейин өзгөрттү.

2. (а) Кыш / Айнпстин чечимдеринин салыштырмалуу соруу маанилери кадимки (көк) жана рактын (кызыл) дна

Куту участокторунун (DA650 / 525); (b) РОК талдоо жана диагностикалык тесттерди баалоо. (c) Нормалдуу жана Рак ооруларынын диагнозу үчүн башаламандык матрицасы. (d) сезгичтиги, өзгөчөлүгү, позитивдүү болжолдуу мааниси (PPV), болжолдуу предметтик мааниси (NPV) жана иштелип чыккан ыкманын тактыгы.

2B сүрөтүндө көрсөтүлгөндөй, өнүккөн сенсор үчүн ROC (AUC = 0.9274) сүрөттө көрсөтүлгөндөй, жогорку сезимталдык жана өзгөчөлүктү көрсөттү Кутучанын участогунан көрүнүп тургандай, кадимки ДНК тобунун эң төмөнкү эң төмөнкү чеки, Рак ДНК тобунун эң жогорку чекиттеринен бөлүнгөн эмес; Ошондуктан, логистикалык регрессия кадимки жана рак топтору менен айырмалоо үчүн колдонулган. Көзкарандысыз өзгөрмөлөрдүн топтомун эске алганда, ал рак же кадимки топ сыяктуу окуя болгон окуянын ыктымалдыгын эсептейт. Көз каранды өзгөрүлмө диапазон 0 жана 1 ортосундагы диапазон. Демек, натыйжа ыктымалдуулук. Биз рак оорусунун (P) δA650 / 525ке негизделген ыктымалдуулукту (П) негизиндеги ыктымалдыгын аныктадык.

мында b = 5.3533, w1 = -6.965. Үлгү классификациясы үчүн, 0,5дан аз ыктымалдуулук кадимки үлгүлөрдү көрсөтөт, ал эми 0,5 же андан жогору ыктымалдыгы рак тандалма үлгүсүн көрсөтөт. 2c Сүрөттөгү башаламандык матрица сүрөттөлөт, ал, классификациялоо ыкмасынын туруктуулугун тастыктоо үчүн колдонулган башаламандык матрицасы сүрөттөлөт. 2-сүрөттө методду, анын ичинде сезгичтигин, өзгөчөлүгүн, позитивдүү предметтик маанисин (PPV) жана терс божомолдоо наркы (NPV) терс маанисин (NPV) (NPV) (NP))

Смартфонго негизделген биосенсор

Спектрофотометрлерди колдонбостон, тандалма тестирлөөнү андан ары жөнөкөйлөтүү үчүн, изилдөөчүлөр жасалма интеллектти (AI) чечимдин түсүн чечмелөө жана кадимки жана рак-жиздерде айырмалоочу жасалма интеллектти колдонушкан. Ушул себептен, компьютердин көрүнүшү Кипт / Айнпстин жана кычкыл ДНКга (кызгылт көк) дна (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт көк) (кызгылт)) сүрөтүн колдонуп, кыстырылган. Жасалма интеллект чыгымдарды кыскартып, нанопартиканын чечимдеринин түсүн чечмелөөдө жана оптикалык аппараттык смартфон аксессуарларды колдонбостон, мүмкүнчүлүктөрдү өркүндөтө алат. Акырында, эки машина үйрөнүү моделдери, анын ичинде кокустук токой (RF) жана вектордук машина (SVM) колдоочу машина (SVM) колдоого алынды. РФ жана СВМ моделдери, үлгүлөрдү туура жана терс деп эсептешет, 90,0% дын тактыгы. Бул уюлдук телефонго негизделген биолсингдеги жасалма акылдарды колдонуу мүмкүн экендигин көрсөтүп турат.

3-сүрөт. (b) Сүрөттү сатып алууда көрүлгөн мисал сүрөт. (в) Ибрагандан алынган 96 жакшы плитанын ар бир кейиште кейптеги цисттүү / аунс эритмесинин түс интенсивдүүлүгү (b).

Изилдөөчүлөр интеллектучылар метиляциялык пейзажды аныктоо үчүн жөнөкөй сезүү аянтчасын ийгиликтүү иштеп чыгышты жана лейкоздук скрининг үчүн чыныгы кан үлгүлөрүн колдонууда рак ДНКдан айырмаланып туруучу сенсорду ийгиликтүү өнүктүрүштү. Өнүккөн сенсор реалдуу кан үлгүлөрүнөн алынган ДНК тез жана нарктык дна (3нм) чакан көлөмүн натыйжалуу аныктоого мүмкүнчүлүгү бар экендигин көрсөттү жана 95,3% так көрсөткүчкө ээ болгон. Спектрофотометр, машина үйрөнүү керектигин жана машинанын үйрөнүүсүн чечүү жана мобилдик телефондун сүрөтүн колдонуп, нормалдуу жана ракетикалык адамдардын ортосунда айырмаланып, 90,0% га чейин жетишилген.

Маалымдама: DOI: 10.1039 / D2RA05725E